Il gioco è sviluppato in un laboratorio segreto situato sul fondo del mare. Qui ha vissuto in solitudine uno scienziato eccentrico, esperienze ed esperimenti colleghi lo accusano. Il suo compito principale era quello di creare un essere vivente dotato di ragione e anni più tardi lo ha fatto. Ma allo stesso tempo il creatore scomparso in circostanze misteriose, lasciando Goo (questo nome ha ricevuto la sua discendenza) e aspettare per lui a perdere. Eroe stanco di appendere fuori in un pallone-macchina fotografica e uscire di esso, è andato in un tour del complesso di trovare tracce del amico scomparso. La possibilità di scegliere il grado di elasticità aiuterà a superare diversi ostacoli, per far fronte al nemico e di penetrare al punto in cui l'uomo comune o come non farsi.